实验室在建设过程中一直坚持“打造优秀学术队伍、建设一流科研平台、强化学科研究特色、服务地方区域经济”的发展宗旨，形成了“天然产物生物制造、生物大分子生物制造及传统发酵过程现代改造”三个稳定的研究方向。针对工业发酵产业现状及问题，研究工业微生物菌种的代谢机理，开展微生物的遗传改造及代谢调控，解决微生物发酵过程的共性及关键技术，并适度延伸传统发酵产业产品技术升级及工艺改造。